A se empareja con T (o U), G con C
Mantiene unidas las dos hebras de ADN
El emparejamiento complementario de bases es la unión específica de bases nitrogenadas mediante puentes de hidrógeno. La adenina se empareja con la timina en el ADN, o con el uracilo en el ARN, mediante dos puentes de hidrógeno, y la guanina con la citosina mediante tres. Cada par une una purina de dos anillos con una pirimidina de un anillo, de modo que la doble hélice de ADN mantiene una anchura uniforme. Como una hebra determina la secuencia de la otra, el emparejamiento de bases permite copiar el ADN durante la replicación y leerlo durante la transcripción.