Два конца полипептидной цепи
Свободная аминогруппа и свободная карбоксильная группа
У каждой полипептидной цепи два разных конца. N-конец несёт свободную аминогруппу (–NH₂) первой аминокислоты, а C-конец — свободную карбоксильную группу (–COOH) последней. Рибосомы строят белки от N-конца к C-концу, присоединяя каждую новую аминокислоту к карбоксильному концу растущей цепи. Поэтому последовательности аминокислот записывают и читают в этом направлении, и обычно они начинаются с метионина (M), который кодирует стартовый кодон. Концы белка часто несут сигналы, например последовательность, которая направляет белок в органеллу.